Il gruppo che si oppone al Colonnello Young tenta di prendere il controllo della Destiny e così militari e civili si trovano su due fronti opposti. La rivolta coincide con il ritorno improvviso delle navi aliene, le quali aprono un pesante fuoco contro il vascello degli Antichi. Rush spiega che, durante la sua prigionia, il nemico gli ha impiantato nel petto una sorta di segnalatore in grado di ritrovarlo. Chloe si offre di rimuoverlo.
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| Titolo Originale | Divided, Part 2 |
| Titolo Italiano | Divisi |