I Wraith minacciano un gruppo di rifugiati collocati dai membri della squadra di Atlantide. Si tratta delle stesse persone con le quali sta lavorando il Dottor Beckett. Gli alieni pretendono che gli abitanti originali di quel mondo consegnino nelle loro mani i sopravvissuti alla terribile piaga di Hoffan, pena la distruzione dell'intero villaggio.